"An approximate likelihood method reveals ancient gene flow between human, chimpanzee and gorilla"

[ENGLISH BELOW] Ce jeu de données est utilisé pour reproduire les analyses de l'article "An approximate likelihood..." et contient l'archive du matériel nécessaire. Les données brutes correspondent à 4 lots d'arbres phylogénétiques de mammifères téléchargés depuis les bases de données OrthoMam v10 (orthomam.mbb.cnrs.fr/) et UCSC Genome Browser (genome.ucsc.edu/). Les requêtes OrthoMam ont été passées manuellement en sélectionnant le type "exon" et en ne mettant aucun filtre sur les champs "relative evolutionary rate", "%GC3", "alpha shape", et "alignment length".

La requête UCSC a été passée via le script ape_non_coding/download_all.bash This dataset is used to reproduce the analyses in manuscript "An approximate likelihood...." and contains the archive of the necessary material. Raw data consist in 4 sets of phylogenetic trees downloaded from the OrthoMam v10 (orthomam.mbb.cnrs.fr/) and UCSC Genome Browser (genome.ucsc.edu/) databases. The OrthoMam database was queried manually, selecting type = "exon" and setting no filter on fields "relative evolutionary rate", "%GC3", "alpha shape", et "alignment length".