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Data · dataset · 2026

Dados cromossômicos e sequências de DNA de linhagens de anuros do complexo de espécies 'Physalaemus cuvieri-Physalaemus ephippifer'

Listed in REDU - Unicamp Institutional Research Data Repository

O conjunto de dados faz parte da pesquisa de doutorado sobre evolução cromossômica em linhagens de anuros do complexo de espécies ‘Physalaemus cuvieri–Physalaemus ephippifer’.

Description

Os dados reúnem fotomicrografias de lâminas com suspensões celulares de anuros, provenientes de intestino ou testículo, pertencentes à Coleção de Tecidos “Shirlei Maria Recco-Pimentel” (SMRP) e provenientes do Laboratório de Estudos Cromossômicos (LabEsC).

As preparações foram submetidas a diferentes técnicas citogenéticas, incluindo coloração convencional com Giemsa a 10%, bandeamento C, para revelar o padrão de heterocromatina constitutiva, impregnação pelo nitrato de prata (Ag-NOR), para evidenciar as Regiões Organizadoras do Nucléolo (NORs), e Hibridação in situ Fluorescente (FISH), utilizando diferentes sequências de DNA repetitivo. As análises citogenéticas serviram de base para comparações cromossômicas entre as linhagens estudadas neste trabalho e os demais cariótipos descritos para anuros do complexo de espécies ‘Physalaemus cuvieri–Physalaemus ephippifer’, considerando que cada linhagem apresenta assinaturas cariotípicas próprias.

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Também foram realizadas análises da fração repetitiva, a partir de short reads dos genomas da Linhagem 3 do complexo de espécies, com o objetivo de investigar o acentuado polimorfismo de NORs observado em seus cariótipos, utilizando o pipeline RepeatExplorer. A partir dessas análises, foi gerada uma biblioteca de DNA repetitivo para essa linhagem. Uma nova sequência repetitiva em tandem, denominada L3Sat-CL37-182, revelou-se associada às NORs, relação posteriormente confirmada por ensaios de FISH.

Além disso, foram incorporadas sequências de DNA mitocondrial (mtDNA) de novos indivíduos às árvores filogenéticas do complexo de espécies ‘Physalaemus cuvieri–Physalaemus ephippifer’. Para isso, foram geradas sequências de mtDNA da Linhagem 3 e de uma nova população de ‘Physalaemus’ sp. proveniente de Vila Bela da Santíssima Trindade, Mato Grosso, Brasil. O conjunto de dados foi obtido como parte dos resultados do trabalho de doutorado, realizado no período de agosto de 2021 a julho de 2026.

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Catalogue records · 1

Topics

Provenance · 1 source records, 9 field assertions
SourceKeyLast seenRaw
REDU - Unicamp Institutional Research Data Repositorydoi:10.25824/redu/29DCTP12 d agoJSON v1
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