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Data · dataset · 2026

Symmetry-based build-up com frequency-based search em PDGDM de proteínas

Listed in REDU - Unicamp Institutional Research Data Repository

Os códigos disponibilizados pelos autores no GitHub geram progressivamente todos os arquivos e pastas utilizados na parte da pesquisa de doutorado referente ao SBBU (Symmetry-Based Build-Up) dotado da busca FBS (Frequency-Based Search).

Description

Contudo, como algumas dessas pastas ocupam uma quantidade significativa de memória — como a pasta que contém os arquivos baixados do PDB (Protein Data Bank), cujo tamanho totaliza 25 gigabytes — os autores decidiram disponibilizar no repositório do GitHub apenas a pasta que contém os dados dos segmentos proteicos, que constitui a informação necessária para efetivamente reproduzir o experimento.

Além disso, no mesmo repositório, os autores fornecem um arquivo ".csv" que lista os IDs do PDB de todas as estruturas 3D de proteínas baixadas. Esse projeto no GitHub também disponibiliza a implementação em C++ do algoritmo SBBU, com buscas do tipo DFS e FBS, bem como os códigos em Python utilizados para gerar os gráficos da tese referentes ao SBBU-FBS.

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Where it is published

Catalogue records · 1

Topics

Provenance · 1 source records, 9 field assertions
SourceKeyLast seenRaw
REDU - Unicamp Institutional Research Data Repositorydoi:10.25824/redu/XYMHUZ12 d agoJSON v1
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