Data · dataset · 2026
Symmetry-based build-up com frequency-based search em PDGDM de proteínas
Listed in REDU - Unicamp Institutional Research Data Repository
Os códigos disponibilizados pelos autores no GitHub geram progressivamente todos os arquivos e pastas utilizados na parte da pesquisa de doutorado referente ao SBBU (Symmetry-Based Build-Up) dotado da busca FBS (Frequency-Based Search).
Description
Contudo, como algumas dessas pastas ocupam uma quantidade significativa de memória — como a pasta que contém os arquivos baixados do PDB (Protein Data Bank), cujo tamanho totaliza 25 gigabytes — os autores decidiram disponibilizar no repositório do GitHub apenas a pasta que contém os dados dos segmentos proteicos, que constitui a informação necessária para efetivamente reproduzir o experimento.
Além disso, no mesmo repositório, os autores fornecem um arquivo ".csv" que lista os IDs do PDB de todas as estruturas 3D de proteínas baixadas. Esse projeto no GitHub também disponibiliza a implementação em C++ do algoritmo SBBU, com buscas do tipo DFS e FBS, bem como os códigos em Python utilizados para gerar os gráficos da tese referentes ao SBBU-FBS.
Links
Where it is published
- Dataverse dataset page redu.unicamp.br/dataset.xhtml?persistentId=doi%3A10.25824%2Fredu%2FXYMHUZ ↗
landing page · from redu unicamp br
- DOI doi.org/10.25824/redu/xymhuz ↗
DOI / persistent id · from redu unicamp br
Catalogue records · 1
- Dataverse API redu.unicamp.br/api/datasets/:persistentId/?persistentId=doi%3A10.25824%2Fredu… ↗
metadata API · from redu unicamp br
Topics
- Stated by source
- Computer and Information Science · Mathematical Sciences
- From keywords
- Mathematics & Statistics
Provenance · 1 source records, 9 field assertions
| Source | Key | Last seen | Raw |
|---|---|---|---|
| REDU - Unicamp Institutional Research Data Repository | doi:10.25824/redu/XYMHUZ | 12 d ago | JSON v1 |
| Field | Assertion | Extractor | Evidence |
|---|---|---|---|
| concepts[field].dataverse_subject:computer-and-information-science | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | /subjects |
| concepts[field].dataverse_subject:mathematical-sciences | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | /subjects |
| concepts[field].local:field:mathematics-statistics | mapping · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | /subjects |
| created_date | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | |
| description | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | /description |
| publication_date | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | |
| title | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | /name |
| updated_date | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 | |
| version_label | source · redu unicamp br | connector:redu_unicamp_br@1.0.0 |