Data · dataset · 2026
Moleculaire detectie van pathogenen in afvalwater
Listed in IISH Dataverse
Het doel van het project is om te komen tot een protocol voor sample en library preparation en tools voor het verminderen van humane ruis in het sequencing proces.
Description
Tijdens dit project wordt er gewerkt aan het opstellen van protocollen voor de moleculaire detectie van (met name SOA) pathogenen in afvalwater, op basis van Next-Generation Sequencing. Sample preparation is daarbij een belangrijk onderdeel in de keten van sample-to-answer en is tijdens dit project de hoofdopdracht voor de analist en studenten die hieraan werken.
Dit is essentieel omdat humane nucleïnezuren het sequencingproces voor identificatie van pathogenen kunnen verstoren. Er wordt gestart met gespiked afvalwater samples om het identificatieproces beter te kunnen volgen.
Links
Where it is published
- Dataverse dataset page dataverse.nl/dataset.xhtml?persistentId=doi%3A10.34894%2FKEXVBM ↗
landing page · from datasets iisg amsterdam
- DOI doi.org/10.34894/kexvbm ↗
DOI / persistent id · from datasets iisg amsterdam
Catalogue records · 1
- Dataverse API dataverse.nl/api/datasets/:persistentId/?persistentId=doi%3A10.34894%2FKEXV… ↗
metadata API · from datasets iisg amsterdam
Topics
- Stated by source
- Earth and Environmental Sciences · Medicine, Health and Life Sciences
- From keywords
- Earth & Environmental Science · Life Sciences · Medicine & Health
- Inferred from text
- Sequencing 75%
Provenance · 1 source records, 12 field assertions
| Source | Key | Last seen | Raw |
|---|---|---|---|
| IISH Dataverse | doi:10.34894/KEXVBM | 13 d ago | JSON v1 |
| Field | Assertion | Extractor | Evidence |
|---|---|---|---|
| concepts[field].dataverse_subject:earth-and-environmental-sciences | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /subjects |
| concepts[field].dataverse_subject:medicine-health-and-life-sciences | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /subjects |
| concepts[field].local:field:earth-environmental | mapping · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /subjects |
| concepts[field].local:field:life-sciences | mapping · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /subjects |
| concepts[field].local:field:medicine-health | mapping · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /subjects |
| concepts[modality].local:modality:sequencing | enrichment · datasets iisg amsterdam | keyword-concept-rules@1.0.0 | title+description (75%) |
| created_date | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | |
| description | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /description |
| publication_date | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | |
| title | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | /name |
| updated_date | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 | |
| version_label | source · datasets iisg amsterdam | connector:datasets_iisg_amsterdam@1.0.0 |